De oorlog heeft grote delen van de oude kerk verwoest. Op het einde van oktober 1944 namen de Engelsen vanuit Boxmeer de torenspits van Heijen onder vuur en schoten deze met 128 treffers omver. In haar val beschadigde ze zeer zwaar het dak en de gewelven van het schip. Toen de Engelsen in februari daaropvolgend vanuit Goch een omtrekkende beweging maakten om de Duitsers aan de Maas in te sluiten, ontwikkelde zich een artilleriegevecht, waarbij de kerk opnieuw verschillende voltreffers kreeg. Dak en zoldering werden nu volledig verwoest. Ook het priesterkoor kreeg bij die gelegenheid een voltreffer en wel achter het hoofdaltaar. Aan oude kunst ging een zilveren stralenmonstrans verloren, die vermoedelijk uit 1711 dateerde. In deze kerk werd ook het oudste orgel, dat Limburg bezat, vernield. Toen bekend werd dat de roof van de klokken zou plaatsvinden, kwamen de dorpelingen op beurt allen luiden, zodat ze de hele dag beierden. Voor het laatst. Er is geen spoor meer van teruggevonden.

Bron: De verwoeste kerken in Limburg / A. van Rijswijck, pr. - 1946